依托于工控系统及安全的优势，电子六所自主研制了智能制造系统的核心工业软件——制造执行系统（MES），面向新能源、电子、轨道交通等行业提出系统化的数字化企业/车间解决方案。其主要研究方向为，面向离散行业的数字化车间/智能工厂系统体系架构技术和整体解决方案、数字化车间布局规划与仿真技术、物流仓储规划仿真技术、基于OPC UA技术的工业物联网络技术、基于图像识别的智能检测技术、工业以太网通信技术、设备数据采集互联技术、企业信息系统集成技术、智能工厂系统信息安全防护技术、智能工厂系统安全检测技术等。

　　目前，电子六所聚焦工业类软件产品，正在研制基于OPC UA的工业物联平台系统、面向多行业的平台化制造执行系统MES、全国产化PLC、数采可信网关、可信审计系统、可信主机卫士等产品。

　　在新能源行业，电子六所具备燃料电池数字化生产线交钥匙工程能力，包含设计、改造、实施、集成、交付、维护等全方位服务；与乐凯胶片、振华新云等单位联合申报工信部智能制造专项项目，两个项目均通过工信部《2017智能制造综合标准化与新模式应用拟立项项目公式》，且获得项目支持。