基于云计算的蛋白质折叠空间结构预测
所属分类:技术论文
上传者:wwei
文档大小:3619 K
标签: 云计算 蛋白质折叠 空间结构预测
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文档介绍:构建基于云计算的蛋白质折叠空间结构预测框架,通过数据云存储设备获取蛋白质序列原始数据,采用HDFS(Hadoop Distributed File System)分布式存储方式保存于云端。资源和队列管理器RQM(Resource Queue Management)开启云端虚拟机后,以之作为扫描节点(Sensor Node, SN),SN基于二维AB非格点模型建立最小蛋白质分子能量优化函数,采用局部搜索机制改进的量子遗传算法对其作优化求解。利用云端GPU设备处理模型训练数据,即可实现蛋白质折叠空间结构的自动化预测。实验结果表明:蛋白质序列能量势函数计算结果更小、执行效率更高、GDT-TS(Geothermal Development and Testing Tool Suite)评价指标值更大。
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