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一种基于Yarn云平台的基因启发式多序列比对算法
所属分类：技术论文
上传者：wwei
文档大小：4376 K
标签：生物数据并行计算分布式计算架构
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文档介绍：提出一种基于Yarn云平台的基因启发式多序列比对算法。建立核酸替换等价矩阵作为基因启发式数学模型，构建Yarn云平台逻辑架构，通过对基因数据预处理、基因数据存储、基因序列比对、基因数据管理、基因数据分析等步骤，对数据分类保存，划分错误率较高的长序列，得到多个较短的基因片段。对不同片段实施定位，将其中的变长种子生成，进行骨架构建和孔隙填补，可以实现基因启发式多序列比对。结果表明，设计的算法在不同数据集下处理时间缩短，多序列比对SP（Sum of Pairs）的分值较高，实验验证了该多序列比对方法具有很好的应用价值。
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